29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0582 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  85.95 
 
 		 142 aa  208  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  66.39 
 
 		 148 aa  140  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  51.28 
 
 		 129 aa  123  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  53.33 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  53.33 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  53.33 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  52.5 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  48.31 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  45.3 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  47.46 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  47.46 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  47.46 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  44.44 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  44.44 
 
 		 127 aa  100  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  40.68 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  40.83 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  39.83 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  23.73 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  26.5 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  35 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  29.13 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  31.45 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  35.59 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1247  GtrA-like protein  36.21 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0226079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6492  hypothetical protein  36.51 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  27.35 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  26.5 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>