55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0350 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  100 
 
 		 137 aa  268  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  46.67 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  38.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  39.67 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  38.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  38.84 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  32 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  37.04 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  30.89 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  32.77 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3257  GtrA family protein  28.93 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.544135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  28.93 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  37.84 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  28.95 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  31.3 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  28.69 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 386 aa  52.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  25.58 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  26.5 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  25.71 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  20.66 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  29.37 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  26.57 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1391  GtrA family protein  32.26 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1596  GtrA family protein  26.83 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00834941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  28.42 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  26.44 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1520  hypothetical protein  32.1 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  25 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  25.84 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  29.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5008  GtrA family protein  26.95 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  25.35 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0277  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.33 
 
 		 373 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0147732  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  23.33 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  30.95 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  28.93 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2360  GtrA-like protein  26.45 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244364 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0318  GtrA family protein  21.83 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0401577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  25.86 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  22.4 
 
 		 160 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2457  hypothetical protein  24.59 
 
 		 128 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2506  hypothetical protein  24.59 
 
 		 128 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  25.36 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  23.2 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  23.2 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  23.2 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  23.2 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  23.2 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  24 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  24.39 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  23.58 
 
 		 371 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1911  GtrA family protein  21.43 
 
 		 419 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0238992 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  25.4 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  20 
 
 		 127 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>