25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1069 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  263  5.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  70.87 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0691  GtrA family protein  37.1 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.329569  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  29.51 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2506  hypothetical protein  32.76 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2457  hypothetical protein  32.76 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  30.51 
 
 		 127 aa  51.2  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  37.33 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  26.44 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0512  GtrA family protein  27.5 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.858233  normal  0.0231289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  31.82 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  31.82 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  31.82 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0167  hypothetical protein  28.97 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.319127  normal  0.557481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  28.32 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0892  hypothetical protein  35.14 
 
 		 141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  29.82 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  30.7 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  29.82 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  29.82 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  31.25 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  32.58 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1704  GtrA-like protein  32.79 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3790  hypothetical protein  31.11 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4307  GtrA family protein  32.23 
 
 		 138 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>