20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4307 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



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Alignment on homolog gene

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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4307  GtrA family protein  100 
 
 
138 aa  256  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.185798  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  32.23 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  37.29 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2457  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2506  hypothetical protein  25 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4544  bactoprenol-linked glucose translocase  29.31 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4459  bactoprenol-linked glucose translocase  29.31 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4543  bactoprenol-linked glucose translocase  29.31 
 
 
120 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663677  normal  0.189983 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0660  bactoprenol-linked glucose translocase  27.2 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.89521  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0669  bactoprenol-linked glucose translocase  27.2 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0725  bactoprenol-linked glucose translocase  27.2 
 
 
120 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.58394 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0609  bactoprenol-linked glucose translocase  26.4 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.268002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0604  bactoprenol-linked glucose translocase  26.4 
 
 
120 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0416  bactoprenol-linked glucose translocase  27.19 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.966976  hitchhiker  0.000337924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0656  bactoprenol-linked glucose translocase  27.19 
 
 
120 aa  43.9  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  37.33 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1308  GtrA family protein  27.42 
 
 
120 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000535922  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  32.39 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1387  GtrA family protein  25.2 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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