15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1308 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1308  GtrA family protein  100 
 
 
120 aa  241  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000535922  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0669  bactoprenol-linked glucose translocase  81.67 
 
 
120 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0725  bactoprenol-linked glucose translocase  81.67 
 
 
120 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.58394 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0660  bactoprenol-linked glucose translocase  81.67 
 
 
120 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.89521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0609  bactoprenol-linked glucose translocase  80.83 
 
 
120 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.268002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0604  bactoprenol-linked glucose translocase  80.83 
 
 
120 aa  209  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0416  bactoprenol-linked glucose translocase  79.17 
 
 
120 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.966976  hitchhiker  0.000337924 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0656  bactoprenol-linked glucose translocase  79.17 
 
 
120 aa  204  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2750  bactoprenol-linked glucose transferase  72.5 
 
 
129 aa  190  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.063262  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4543  bactoprenol-linked glucose translocase  69.17 
 
 
120 aa  180  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663677  normal  0.189983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4544  bactoprenol-linked glucose translocase  68.33 
 
 
120 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4459  bactoprenol-linked glucose translocase  68.33 
 
 
120 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0126  GtrA family protein  54.24 
 
 
119 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  56.78 
 
 
118 aa  137  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  45.69 
 
 
123 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
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