24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0641 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.393206 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1308  GtrA family protein  56.78 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000535922  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0660  bactoprenol-linked glucose translocase  55.93 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.89521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0725  bactoprenol-linked glucose translocase  55.93 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.58394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0669  bactoprenol-linked glucose translocase  55.93 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0609  bactoprenol-linked glucose translocase  55.08 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.268002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0604  bactoprenol-linked glucose translocase  55.08 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0656  bactoprenol-linked glucose translocase  54.24 
 
 		 120 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0416  bactoprenol-linked glucose translocase  54.24 
 
 		 120 aa  133  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.966976  hitchhiker  0.000337924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0126  GtrA family protein  51.69 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4459  bactoprenol-linked glucose translocase  52.54 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4544  bactoprenol-linked glucose translocase  52.54 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2750  bactoprenol-linked glucose transferase  50.85 
 
 		 129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.063262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4543  bactoprenol-linked glucose translocase  51.69 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663677  normal  0.189983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  42.11 
 
 		 123 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  34.07 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  34.52 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  29.79 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  29.79 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  36.11 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.426986 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  31.03 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  31.03 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  31.03 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
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NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  34.72 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
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