23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3686 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  100 
 
 
128 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  100 
 
 
128 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  100 
 
 
128 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  91.41 
 
 
128 aa  231  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  70.83 
 
 
129 aa  166  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  66.12 
 
 
127 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  65.29 
 
 
127 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  63.2 
 
 
127 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  63.2 
 
 
127 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  63.2 
 
 
127 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  63.87 
 
 
128 aa  152  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  63.03 
 
 
128 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  63.03 
 
 
128 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  63.03 
 
 
128 aa  147  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  47.86 
 
 
142 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  47.46 
 
 
121 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  48.72 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  40.83 
 
 
129 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  41.88 
 
 
120 aa  84  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  24.06 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  33.06 
 
 
173 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0641  bactoprenol-linked glucose translocase (flippase)  31.03 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.393206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  27.48 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>