24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A3073 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  92.19 
 
 
128 aa  226  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4524  GtrA-like protein  63.03 
 
 
128 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3840  GtrA family protein  63.03 
 
 
128 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0764711  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3686  GtrA family protein  63.03 
 
 
128 aa  147  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.104417  normal  0.128502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2257  GtrA-like protein  61.34 
 
 
128 aa  147  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155693  normal  0.0540775 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7211  hypothetical protein  54.55 
 
 
129 aa  131  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.778589  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  51.26 
 
 
127 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  52.1 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  52.1 
 
 
127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5987  GtrA family protein  47.9 
 
 
127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6283  GtrA family protein  47.06 
 
 
127 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113068  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  53.33 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  50.4 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  44.44 
 
 
129 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0658  GtrA-like protein  50.43 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.426986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1381  GtrA-like protein  40 
 
 
120 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  31.71 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  29.47 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  25.4 
 
 
139 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  25.66 
 
 
170 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  23.2 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>