21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0267 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  100 
 
 
170 aa  343  5e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  51.03 
 
 
146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  55.81 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  55.81 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  55.81 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  54.41 
 
 
131 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  54.76 
 
 
121 aa  125  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  52.99 
 
 
133 aa  120  9e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  40 
 
 
150 aa  87  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  27.52 
 
 
128 aa  44.7  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  32.77 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  28.3 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  27.91 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  25 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  25.66 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  25.66 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  25.66 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  36.21 
 
 
200 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  23.53 
 
 
139 aa  41.6  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  31.71 
 
 
123 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  23.61 
 
 
146 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>