40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0074 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  100 
 
 
146 aa  284  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  46.15 
 
 
191 aa  107  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  43.2 
 
 
135 aa  84  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  31.15 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  37.9 
 
 
129 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  36.8 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  28.69 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  28.69 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  29.27 
 
 
169 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  34.62 
 
 
184 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  31.11 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  29.77 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4046  hypothetical protein  34.51 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0836532  normal  0.23815 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  32.28 
 
 
134 aa  48.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  36.36 
 
 
145 aa  47  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  27.27 
 
 
240 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  35.77 
 
 
340 aa  45.8  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  26.67 
 
 
194 aa  45.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.15 
 
 
371 aa  45.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  30.21 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  26.02 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  33.01 
 
 
186 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  26.02 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  26.02 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  26.02 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1911  GtrA family protein  29.08 
 
 
419 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0238992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  31.01 
 
 
160 aa  42  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  33.33 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  34.52 
 
 
158 aa  42  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  34.34 
 
 
142 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  30.83 
 
 
171 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
412 aa  41.6  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  25.76 
 
 
227 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3088  GtrA family protein  36 
 
 
703 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  23.61 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  24.39 
 
 
137 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  27.16 
 
 
191 aa  40  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  27.04 
 
 
200 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  23.73 
 
 
272 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0526  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.53 
 
 
340 aa  40  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>