43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1472 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  100 
 
 
145 aa  293  6e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.46 
 
 
371 aa  57  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  26.23 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  31.97 
 
 
141 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  28.79 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  25 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1911  GtrA family protein  31.54 
 
 
419 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0238992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0022  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
412 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.882894  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  20.66 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  29.17 
 
 
127 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.87 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  22.88 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  30 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  30 
 
 
127 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0318  GtrA family protein  30.14 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0401577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0197  dolichyl-phosphate beta-d-mannosyltransferase  31.2 
 
 
413 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0265361  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  36.36 
 
 
146 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  25.66 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3095  GtrA family protein  29.46 
 
 
153 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0522418 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  26.19 
 
 
386 aa  45.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  29.51 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  34.12 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  27.5 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  25.83 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0778  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
414 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12213  hitchhiker  0.000342475 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0150  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.23 
 
 
388 aa  43.9  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  29.47 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
370 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  37.68 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  24.59 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  24.37 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.37 
 
 
397 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  33.82 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  22.5 
 
 
155 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  30.37 
 
 
176 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  24.19 
 
 
376 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  35 
 
 
146 aa  41.2  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  25.86 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  29.03 
 
 
191 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  28.57 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  23.14 
 
 
136 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  24.37 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  25.78 
 
 
169 aa  40  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>