11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3095 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3095  GtrA family protein  100 
 
 		 153 aa  313  5e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0522418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3797  hypothetical protein  48.92 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.484797  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1524  GtrA family protein  31.15 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  29.46 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  30.37 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2402  hypothetical protein  24.81 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460093  normal  0.149957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  30.08 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  31.3 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  30.09 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  25 
 
 		 164 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  28.74 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>