40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23230 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  100 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  43.07 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  33.85 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  32.37 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  35.04 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  28 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  28.33 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  26.23 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  30.43 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.4 
 
 		 376 aa  48.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  32.54 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.41 
 
 		 147 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  30.09 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.06 
 
 		 371 aa  45.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  25.2 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  28.68 
 
 		 136 aa  45.1  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  25.66 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  28.09 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  28.57 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  24.06 
 
 		 127 aa  43.9  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  24.39 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  24.39 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  27.27 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  28.81 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  29.35 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  28 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  25.76 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  28 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3095  GtrA family protein  25.83 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0522418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  28.12 
 
 		 144 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  25.95 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  26.05 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14690  hypothetical protein  25.22 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0877793  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2360  GtrA-like protein  36.49 
 
 		 130 aa  41.2  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  25.74 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  29.6 
 
 		 125 aa  41.2  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  26.37 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  20.49 
 
 		 139 aa  40.8  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  26.14 
 
 		 240 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  25.29 
 
 		 200 aa  40.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>