37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0136 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  243  4.9999999999999997e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  40.83 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  41.18 
 
 		 159 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  40 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  40.16 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  34.75 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  30.25 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  34.48 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  34.48 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  34.48 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  34.45 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  34.48 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  34.45 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  39.17 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  37.5 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  31.93 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  27.27 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  27.5 
 
 		 131 aa  50.4  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  27.17 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  28.81 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  28.57 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  24.79 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  28.1 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  29.17 
 
 		 129 aa  43.5  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  27.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  27.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  27.35 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  31.31 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  28.21 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  29.31 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  27.78 
 
 		 130 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  31.71 
 
 		 170 aa  41.2  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  23.53 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  31.67 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1391  GtrA family protein  32.18 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  34.18 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0562  GtrA family protein  30 
 
 		 140 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>