36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4424 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  100 
 
 		 159 aa  313  6e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  71.72 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  52.94 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  46.46 
 
 		 144 aa  93.6  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  51.26 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  41.18 
 
 		 123 aa  89.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  45 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  37.69 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  37.5 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  37.5 
 
 		 170 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  33.05 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  24.81 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  35.34 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  31.93 
 
 		 131 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  32.23 
 
 		 127 aa  51.6  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  28.57 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  26.45 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  30.77 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  30.77 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  30.77 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  30.77 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  35.24 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  35.24 
 
 		 127 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  27.64 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  25.89 
 
 		 128 aa  47.4  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  30 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  32.58 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  30.71 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  25.83 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  24.8 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  25.96 
 
 		 127 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  25.96 
 
 		 127 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  26.4 
 
 		 129 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  25.96 
 
 		 127 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 		 370 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  28.46 
 
 		 130 aa  40.4  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>