41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2749 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  100 
 
 
144 aa  281  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  46.46 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  48.82 
 
 
151 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  48.33 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  44.26 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  49.17 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  39.17 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  38.52 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  38.52 
 
 
170 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  35.19 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  34.15 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  35.54 
 
 
131 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  35.4 
 
 
127 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0562  GtrA family protein  30.53 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  25.78 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  30.86 
 
 
184 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  26.79 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  31.09 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  31.09 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  31.09 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  31.09 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  32.97 
 
 
127 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  31.54 
 
 
129 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  32.97 
 
 
127 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  29.53 
 
 
200 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0598  GtrA family protein  31.3 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  30.28 
 
 
221 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  29.1 
 
 
169 aa  45.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  22.66 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  26.36 
 
 
171 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  32.2 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  22.66 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  22.66 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  26.89 
 
 
129 aa  43.5  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  22.66 
 
 
127 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  29.23 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  25.95 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1525  GtrA family protein  31.31 
 
 
148 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  24.19 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  29.09 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  27.66 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>