29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5371 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  100 
 
 
131 aa  261  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1489  GtrA family protein  69.53 
 
 
149 aa  177  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658606 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  41.67 
 
 
170 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  41.67 
 
 
170 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  43.8 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  41.32 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  41.32 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  31.97 
 
 
135 aa  58.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  31.75 
 
 
159 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  37.7 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  27.87 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  27.87 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  28.57 
 
 
127 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  35.54 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  27.5 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  26.89 
 
 
127 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0049  GtrA family protein  29.84 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000705779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0049  GtrA family protein  29.84 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0052  GtrA family protein  29.84 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0615558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0035  GtrA family protein  29.84 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000029662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  29.84 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  30.47 
 
 
141 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  29.32 
 
 
134 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  26.05 
 
 
133 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  33.33 
 
 
151 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  35.23 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3257  GtrA family protein  27.64 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.544135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  28.24 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  21.85 
 
 
139 aa  41.6  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>