17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2194 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  40.83 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  37.69 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3397  GtrA family protein  38.89 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.13749 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  31.45 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2814  GtrA family protein  36 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4177  GtrA family protein  31.15 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4289  GtrA family protein  31.15 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0858914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  35.34 
 
 		 164 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2749  GtrA family protein  34.15 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  30.17 
 
 		 139 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  30.4 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  29.46 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  35.96 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  23.97 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  26.09 
 
 		 134 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  26.77 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>