30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1598 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  43.65 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.52 
 
 
371 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  33.04 
 
 
139 aa  63.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  33.86 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  32.85 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  28.95 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.17 
 
 
376 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  28.95 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  27.83 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1596  GtrA family protein  33.96 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00834941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0875  GtrA family protein  28.46 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  25 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1524  GtrA family protein  26.55 
 
 
125 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0966901  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  23.48 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  26.72 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1876  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  25.98 
 
 
384 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  28.57 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  24.35 
 
 
139 aa  44.3  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  26.57 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  32.81 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  30.09 
 
 
164 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14690  hypothetical protein  27.54 
 
 
175 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0877793  normal  0.21738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  24.8 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  28.33 
 
 
386 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  22.5 
 
 
145 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26101  putative glycosyl transferase  26.4 
 
 
367 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0150  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.51 
 
 
388 aa  41.6  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  23.97 
 
 
134 aa  41.6  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2369  putative glycosyl transferase  27.56 
 
 
376 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>