18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3931 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  100 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  70.87 
 
 		 132 aa  188  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0691  GtrA family protein  37.82 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.329569  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  28.69 
 
 		 128 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2506  hypothetical protein  30.51 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.172185  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2457  hypothetical protein  30.51 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0512  GtrA family protein  28.95 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.858233  normal  0.0231289 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  31 
 
 		 131 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  27.88 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  28.42 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  28.7 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1626  GtrA family protein  27.34 
 
 		 137 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.944895  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  32.53 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  32.53 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  32.53 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  32.81 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  25.64 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  34.85 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>