17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0349 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  100 
 
 
127 aa  245  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  32 
 
 
137 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  32.23 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  29.17 
 
 
143 aa  53.9  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1391  GtrA family protein  35.11 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  30.17 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  30.51 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  28.7 
 
 
129 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  29.57 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  29.57 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  29.57 
 
 
127 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2009  hypothetical protein  28.81 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  25.83 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3257  GtrA family protein  21.67 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.544135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  26.96 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4796  hypothetical protein  24.24 
 
 
631 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.518847  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  26.5 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>