24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13823 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  100 
 
 		 121 aa  239  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  67.5 
 
 		 131 aa  163  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  69.49 
 
 		 133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  66.95 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  66.95 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  66.95 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  54.76 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  52.76 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  52.07 
 
 		 150 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  35.96 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  26.05 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  30.77 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  30.16 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  23.73 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  25.21 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  33.33 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  27.93 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0349  GtrA family protein  25.83 
 
 		 127 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.907419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  33.64 
 
 		 133 aa  43.5  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  29.46 
 
 		 267 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  27.78 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  35.79 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  28.68 
 
 		 267 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  37.5 
 
 		 134 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>