60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4221 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  100 
 
 		 200 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  52.8 
 
 		 180 aa  179  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  56.69 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  56.64 
 
 		 184 aa  175  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  48.07 
 
 		 272 aa  164  9e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  48.8 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  48.8 
 
 		 229 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  48.8 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  50 
 
 		 227 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  48.41 
 
 		 171 aa  157  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  52.05 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  43.98 
 
 		 194 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  48.75 
 
 		 186 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  34.62 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  37.02 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  36.57 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  39.72 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  38.06 
 
 		 267 aa  97.4  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  34.03 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  36.57 
 
 		 267 aa  92.4  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  35.62 
 
 		 220 aa  91.3  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  41.61 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  38.57 
 
 		 166 aa  90.1  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  39.88 
 
 		 162 aa  88.6  5e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  33.48 
 
 		 220 aa  87.8  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  33.33 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  37.86 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  33.53 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  34.06 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  29.93 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  35.03 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  36.88 
 
 		 165 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  29.3 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  28.11 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  32.51 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  37.25 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  34.72 
 
 		 231 aa  72  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  32.12 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  32.64 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  30.6 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  34.56 
 
 		 151 aa  67.8  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  29.94 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  30.5 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  35.96 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  26.84 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  32.37 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  39.06 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  39.06 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  39.06 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  31.76 
 
 		 133 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  31.76 
 
 		 131 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  28.74 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  30.34 
 
 		 129 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  32.65 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  30.43 
 
 		 124 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  31.71 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  35.71 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  27.27 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  36.21 
 
 		 170 aa  42.4  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  44.07 
 
 		 142 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>