23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4999 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  100 
 
 		 139 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  100 
 
 		 139 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  100 
 
 		 139 aa  280  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  85.71 
 
 		 133 aa  236  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  80.62 
 
 		 131 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  66.95 
 
 		 121 aa  157  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  55.81 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  55.56 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  48.46 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  28.24 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  39.06 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  31.82 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  27.52 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  32.53 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  38.89 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  29.01 
 
 		 143 aa  43.5  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  31.33 
 
 		 125 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0862  GtrA family protein  24 
 
 		 123 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  25 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  25 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  25 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  25 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  36.99 
 
 		 135 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>