21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1179 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  90.7 
 
 
131 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  85.71 
 
 
139 aa  236  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  85.71 
 
 
139 aa  236  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  85.71 
 
 
139 aa  236  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  69.49 
 
 
121 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  52.99 
 
 
170 aa  120  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  53.73 
 
 
146 aa  117  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  47.69 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3931  GtrA family protein  27.88 
 
 
129 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26697  normal  0.166614 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  31.76 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  28.32 
 
 
132 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2875  GtrA family protein  31.67 
 
 
135 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  27.94 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  35.19 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  25.27 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  23.08 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  22.66 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5371  GtrA family protein  29.6 
 
 
131 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6498  GtrA family protein  27.5 
 
 
121 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129546  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3257  GtrA family protein  27.61 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.544135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>