47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4106 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  100 
 
 		 146 aa  290  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  51.03 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5380  GtrA family protein  55.56 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.893134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4999  GtrA-like protein  55.56 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5087  GtrA family protein  55.56 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.995907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  54.07 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1179  GtrA family protein  53.73 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  52.76 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  41.26 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  32.63 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  30.38 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1300  hypothetical protein  29.47 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2947  hypothetical protein  29.47 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3073  hypothetical protein  29.47 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162073  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  25.78 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  28.68 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0582  GtrA family protein  35.59 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  25.84 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2258  GtrA-like protein family protein  31.4 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  32.65 
 
 		 200 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  27.41 
 
 		 129 aa  43.9  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  26.92 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  25.38 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  33.33 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1069  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.612497  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  34.48 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  25 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  25 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2019  GtrA family protein  33.78 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.781092  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1553  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  32.32 
 
 		 229 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  32.32 
 
 		 229 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  32.32 
 
 		 229 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  27.61 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  35 
 
 		 145 aa  41.2  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  32.35 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  36.36 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  31.3 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  37.14 
 
 		 166 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  25.81 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  36.36 
 
 		 240 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  21.77 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  34.18 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  31.25 
 
 		 127 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  31.25 
 
 		 127 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  29.63 
 
 		 194 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>