22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0865 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  100 
 
 
129 aa  251  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  46.51 
 
 
152 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  44.62 
 
 
135 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  46.83 
 
 
127 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  37.9 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  35.2 
 
 
124 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  33.06 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  29.69 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  29.69 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  40.16 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  28.35 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  40.8 
 
 
125 aa  57  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  28.78 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  27.56 
 
 
191 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16020  hypothetical protein  43.64 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000816114  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  28.46 
 
 
150 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  27.41 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  28.57 
 
 
116 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  25.78 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  31.45 
 
 
370 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  28.79 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1862  hypothetical protein  24.8 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.548626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>