23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0174 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  100 
 
 		 135 aa  260  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  44.19 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  44.62 
 
 		 129 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  43.2 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  37.21 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0550  GtrA family protein  40.6 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000966323  normal  0.789698 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  34.92 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  41.07 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  41.07 
 
 		 149 aa  51.2  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2953  GtrA family protein  36.09 
 
 		 698 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0863375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  26.76 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  34.09 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  30.23 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01410  predicted membrane protein  30 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.16312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5626  GtrA family protein  33.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.558641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  31.65 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  33.33 
 
 		 166 aa  41.2  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.07 
 
 		 345 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4249  GtrA family protein  31.54 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000330424  unclonable  0.0000000113539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  29.5 
 
 		 158 aa  40.8  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16020  hypothetical protein  43.86 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000816114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>