59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1157 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  100 
 
 		 166 aa  330  4e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  75.38 
 
 		 180 aa  203  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  63.16 
 
 		 158 aa  180  7e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  56.2 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  49.36 
 
 		 220 aa  131  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  50 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  41.03 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  46.48 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  47.02 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  40.37 
 
 		 202 aa  114  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  43.84 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  48.94 
 
 		 162 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  39.35 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  39.01 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  39.35 
 
 		 221 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  43.14 
 
 		 267 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  41.18 
 
 		 155 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  42.25 
 
 		 267 aa  98.2  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  42.11 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  39.01 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  43.54 
 
 		 182 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  51.11 
 
 		 154 aa  91.3  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  37.14 
 
 		 184 aa  90.9  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  36.36 
 
 		 171 aa  90.1  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  38.57 
 
 		 200 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  37.86 
 
 		 229 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  37.86 
 
 		 229 aa  88.6  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  37.86 
 
 		 229 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  34.29 
 
 		 272 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  35.71 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  35.92 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  35 
 
 		 240 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  34.29 
 
 		 227 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  37.84 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  42.86 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  33.12 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  36.88 
 
 		 194 aa  78.2  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  36.97 
 
 		 184 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  34.72 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  33.33 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  36.43 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  35 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  32.14 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  29.73 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  27.34 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  29.91 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  37.04 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  29.01 
 
 		 125 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  28.36 
 
 		 125 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  31.21 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  31.43 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  28.57 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  27.5 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  30.23 
 
 		 125 aa  41.6  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  33.33 
 
 		 135 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  24.29 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  30 
 
 		 124 aa  41.2  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  37.14 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  29.35 
 
 		 178 aa  40.4  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>