51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0707 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  72.16 
 
 		 191 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  42.02 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  44.83 
 
 		 169 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  41.28 
 
 		 206 aa  131  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  44.52 
 
 		 221 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  48.25 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  48.53 
 
 		 163 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  44.37 
 
 		 267 aa  121  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  43.17 
 
 		 155 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  42.14 
 
 		 267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  41.1 
 
 		 162 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  39.53 
 
 		 220 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  39.01 
 
 		 166 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  41.61 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  45.77 
 
 		 231 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  37.02 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  39.1 
 
 		 169 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  42.22 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  43.08 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  43.88 
 
 		 230 aa  97.8  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  38.24 
 
 		 202 aa  93.2  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  35.77 
 
 		 188 aa  89  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  35.2 
 
 		 151 aa  88.2  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  37.41 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  38.13 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  36.43 
 
 		 272 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  35.62 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  33.12 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  36.3 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  36.3 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  36.3 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  37.04 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  35.71 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  34.33 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  41.41 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  36.43 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  32.16 
 
 		 194 aa  77.8  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  31.36 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  39.06 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  31.16 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  35.37 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  32.41 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  34.92 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  32 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  32.95 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  25.6 
 
 		 139 aa  47.8  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  24.49 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  31.71 
 
 		 425 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  28.03 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  31.43 
 
 		 142 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>