58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4120 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  100 
 
 		 221 aa  443  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  58.87 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  55.56 
 
 		 165 aa  167  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  46.99 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  48.46 
 
 		 151 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  47.02 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  46.1 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  45.86 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  44.52 
 
 		 190 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  48.92 
 
 		 155 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  43.71 
 
 		 169 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  49.01 
 
 		 162 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  38.98 
 
 		 169 aa  119  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  41.56 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  44.9 
 
 		 231 aa  105  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  42.31 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  39.35 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  40.71 
 
 		 160 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  44.88 
 
 		 163 aa  102  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  37.5 
 
 		 151 aa  94.4  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  41.56 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  38.26 
 
 		 202 aa  90.5  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  35.25 
 
 		 186 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  39.85 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  40.77 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  36.3 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  35.07 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  35.07 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  35.07 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  37.69 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  32.59 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  28.11 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  33.82 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  32.9 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  34.29 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  35.57 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  31.34 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  31.34 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  30.39 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  34.04 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  32.03 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  30.43 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  36.47 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  27.92 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  36.84 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  27.21 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  31.71 
 
 		 127 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  31.71 
 
 		 127 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  25.97 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  32.43 
 
 		 425 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  32.18 
 
 		 139 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2707  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.03 
 
 		 384 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 		 416 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  30.89 
 
 		 127 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1342  GtrA family protein  26.83 
 
 		 169 aa  45.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00972565  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  26.05 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  28.35 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  27.45 
 
 		 134 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>