52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0404 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  57.52 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  51.27 
 
 		 267 aa  147  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  49.01 
 
 		 221 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  51.27 
 
 		 267 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  48.98 
 
 		 220 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  54.89 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  45.73 
 
 		 206 aa  134  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  47.86 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  52.86 
 
 		 220 aa  130  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  47.86 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  52.27 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  48.94 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  44.03 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  47.92 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  45.95 
 
 		 169 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  44.59 
 
 		 231 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  49.28 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  42.24 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  42.48 
 
 		 230 aa  108  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  39.88 
 
 		 200 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  43.45 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  42.97 
 
 		 151 aa  104  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  40.79 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  55.43 
 
 		 154 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  41.35 
 
 		 202 aa  97.1  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  37.59 
 
 		 147 aa  92.8  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  36.42 
 
 		 272 aa  92  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  37.59 
 
 		 188 aa  91.3  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  36.24 
 
 		 229 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  36.24 
 
 		 229 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  36.24 
 
 		 229 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  35.8 
 
 		 240 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  35.19 
 
 		 227 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  36.91 
 
 		 180 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  36.76 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  39.6 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  32.3 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  31.71 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  41.18 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  33.11 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  38.52 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  30.95 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  33.33 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  37.25 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  29.29 
 
 		 192 aa  60.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  29.01 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  30.66 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  27.94 
 
 		 416 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  27.21 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  29.7 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13823  integral membrane protein  35.11 
 
 		 121 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>