59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4748 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  100 
 
 
227 aa  463  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  91.19 
 
 
240 aa  410  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  82.97 
 
 
229 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  82.97 
 
 
229 aa  362  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  82.97 
 
 
229 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  77.19 
 
 
272 aa  355  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  63.98 
 
 
186 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  59.52 
 
 
186 aa  207  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  57.58 
 
 
184 aa  202  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  58.54 
 
 
180 aa  201  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  56.89 
 
 
194 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  55.15 
 
 
171 aa  181  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  50 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  40.28 
 
 
206 aa  101  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  39.26 
 
 
267 aa  92.8  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  35.51 
 
 
163 aa  93.2  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  38 
 
 
267 aa  92  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  37.96 
 
 
180 aa  91.7  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  29.41 
 
 
202 aa  87.8  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  34.29 
 
 
166 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  35.46 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  29.19 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  35.14 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  38.52 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  35.71 
 
 
190 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  36.3 
 
 
230 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  36.43 
 
 
165 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  41.9 
 
 
154 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  32.18 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  33.58 
 
 
182 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  32.12 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  31.82 
 
 
155 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  35.19 
 
 
162 aa  70.5  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  33.09 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  30.6 
 
 
151 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  32 
 
 
169 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  28.19 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  30.41 
 
 
160 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  29.88 
 
 
192 aa  55.1  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  26.75 
 
 
147 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  28.74 
 
 
178 aa  53.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  28.97 
 
 
176 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  28.87 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  31.91 
 
 
165 aa  48.9  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  22.3 
 
 
143 aa  48.5  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  30.28 
 
 
213 aa  48.5  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  27.46 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  34.31 
 
 
129 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  28.15 
 
 
124 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.68 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  27.74 
 
 
125 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  22.88 
 
 
155 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  26.87 
 
 
148 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1833  hypothetical protein  29.63 
 
 
159 aa  43.5  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  37.31 
 
 
131 aa  42.7  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  29.2 
 
 
125 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  30.94 
 
 
146 aa  42.4  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  23.29 
 
 
171 aa  42  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4236  GtrA-like protein  34.23 
 
 
176 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>