12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1833 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1833  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  313  4e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0440  hypothetical protein  28.99 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.556232 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1017  hypothetical protein  31.06 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0557375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  27.12 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  29.63 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  29.63 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  29.63 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  29.63 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  25 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  29.63 
 
 		 240 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  30.28 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  34.48 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>