60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0801 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  100 
 
 		 169 aa  344  3e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  48.37 
 
 		 231 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  50.98 
 
 		 230 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  38.98 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  43.24 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  41.89 
 
 		 191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  39.13 
 
 		 220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  45.95 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  39.1 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  38.51 
 
 		 206 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  39.04 
 
 		 267 aa  91.7  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  38.62 
 
 		 267 aa  89.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  37.68 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  33.33 
 
 		 151 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  39.35 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  32.26 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  36.36 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  34.67 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  33.33 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  34.39 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  34.25 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  32.08 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  33.85 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  37.31 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  35.25 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  31.39 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  31.01 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  32.67 
 
 		 240 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  29.94 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  30.67 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  30.67 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  30.67 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  31.9 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  32.35 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  32.64 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  28.07 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  32 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  31.25 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  27.38 
 
 		 186 aa  62  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  32.43 
 
 		 272 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  29.27 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  39.29 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  29.66 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  29.87 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  27.81 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  32.69 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  26.57 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  33.57 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1833  hypothetical protein  27.12 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  35.42 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  24.78 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6382  GtrA family protein  29.27 
 
 		 127 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.491953 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  34.21 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  34.21 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  34.21 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  35.48 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  29.27 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  29.27 
 
 		 127 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0538  GtrA family protein  27.82 
 
 		 142 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.281821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  22.73 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>