59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  100 
 
 		 180 aa  358  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  70.07 
 
 		 166 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  62.5 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  55.97 
 
 		 163 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  56.21 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  49.35 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  41.08 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  40.67 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  47.89 
 
 		 165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  52.63 
 
 		 162 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  42.36 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  41.54 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  41.76 
 
 		 267 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  36.9 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  44.53 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  42.03 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  40 
 
 		 272 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  39.58 
 
 		 186 aa  95.1  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  36.54 
 
 		 227 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  37.18 
 
 		 240 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  36.54 
 
 		 184 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  40.41 
 
 		 200 aa  92.8  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  38.24 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  39.19 
 
 		 147 aa  87.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  34.62 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  46.81 
 
 		 154 aa  85.9  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  34.62 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  34.62 
 
 		 229 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  35.82 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  38.97 
 
 		 151 aa  85.1  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  39.58 
 
 		 221 aa  84.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  36.3 
 
 		 180 aa  84.7  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  44.27 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  34.9 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  39.33 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  41.54 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  40.58 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  39.13 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  37.69 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  32.9 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  35.25 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  31.76 
 
 		 194 aa  70.9  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  35.21 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  39.26 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  31.62 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  31.62 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  30.43 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  34.88 
 
 		 142 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  29.2 
 
 		 152 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02789  hypothetical protein  35 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0174  GtrA family protein  31.65 
 
 		 135 aa  44.3  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  26.19 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  28.7 
 
 		 134 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  30.43 
 
 		 178 aa  41.6  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  29.55 
 
 		 125 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0865  GtrA family protein  28.79 
 
 		 129 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.915349 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  30.3 
 
 		 125 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0405  GtrA family protein  30.47 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.317028 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5438  GtrA-like protein  31.85 
 
 		 125 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.596348  normal  0.387409 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>