18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0747 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  100 
 
 
134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  43.65 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  32.74 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.31 
 
 
371 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0350  GtrA family protein  25.58 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  28.46 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  27.5 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  31.3 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  27.82 
 
 
155 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  23.89 
 
 
143 aa  44.7  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  27.42 
 
 
130 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1520  hypothetical protein  26.92 
 
 
159 aa  42.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  28.7 
 
 
180 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 
386 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2399  hypothetical protein  42.19 
 
 
129 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  25.22 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  26.09 
 
 
134 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0124  GtrA family protein  29.01 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>