46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1247 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  100 
 
 
139 aa  278  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  43.07 
 
 
164 aa  107  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  45.38 
 
 
178 aa  104  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  46.31 
 
 
171 aa  103  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0747  GtrA family protein  32.74 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.140616 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  34.62 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0058  GtrA family protein  31.78 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1598  GtrA family protein  33.04 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.107787  normal  0.139272 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1468  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.09 
 
 
371 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  29.67 
 
 
191 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  35.71 
 
 
165 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  30.09 
 
 
213 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  32.95 
 
 
190 aa  57.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  32.53 
 
 
267 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  29.91 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6129  Bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA-like protein  30.4 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.915584  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  31.33 
 
 
267 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2194  hypothetical protein  30.17 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0664804  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1750  GtrA family protein  35.63 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5967  bactoprenol-linked glucose translocase (Flippase) GtrA  35.63 
 
 
127 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.360184  normal  0.019808 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  33.05 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  33.05 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  33.05 
 
 
127 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4424  GtrA family protein  28.57 
 
 
159 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208772  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0406  GtcA family membrane protein  27.35 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1472  GtrA family protein  22.88 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.266635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  29.67 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  30.23 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  30.53 
 
 
163 aa  48.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  25.98 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  26.53 
 
 
202 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  30.77 
 
 
220 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  32.18 
 
 
221 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  34.31 
 
 
162 aa  46.2  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  26.53 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  28.57 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  28.28 
 
 
169 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  30.53 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  28.69 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  31.71 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  24.59 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18800  GtrA family protein  29.17 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000044791  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0136  hypothetical protein  29.31 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.184565  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5111  GtrA family membrane protein  30.51 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3635  GtrA family protein  26.89 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6498  GtrA family protein  31.3 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.129546  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>