11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0406 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0406  GtcA family membrane protein  100 
 
 		 151 aa  304  2.0000000000000002e-82  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1387  GtrA family protein  28.78 
 
 		 145 aa  83.6  8e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1342  GtrA family protein  30.77 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00972565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1394  GtcA family membrane protein  29.2 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00340458  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0698  GtcA family membrane protein  30.43 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0633  GtcA family membrane protein  29.86 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  27.35 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  29.41 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  30.65 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0289  GtrA family protein  25.9 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>