66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3747 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  100 
 
 
186 aa  370  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  65.68 
 
 
184 aa  241  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  64.6 
 
 
272 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  67.08 
 
 
180 aa  221  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  63.98 
 
 
227 aa  221  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  62.73 
 
 
240 aa  217  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  63.06 
 
 
229 aa  214  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  63.06 
 
 
229 aa  214  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  63.06 
 
 
229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  62.89 
 
 
171 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  49.44 
 
 
186 aa  184  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  56.69 
 
 
200 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  42.94 
 
 
194 aa  167  7e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  40.4 
 
 
267 aa  94.4  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  36.42 
 
 
206 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  34.84 
 
 
202 aa  94  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  39.01 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  40.15 
 
 
180 aa  93.2  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  41.04 
 
 
267 aa  92  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  37.25 
 
 
165 aa  89.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  36.23 
 
 
163 aa  88.2  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  37.41 
 
 
190 aa  87.4  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  35.25 
 
 
221 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  34.02 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  33.92 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  34.97 
 
 
220 aa  81.3  0.000000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  32 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  33.33 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  34.67 
 
 
169 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  33.33 
 
 
230 aa  75.5  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  33.58 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  38.32 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  34.62 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  30.14 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  31.88 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  33.09 
 
 
162 aa  68.2  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  34.31 
 
 
182 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  29.22 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  30.15 
 
 
160 aa  61.6  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  32.61 
 
 
194 aa  61.6  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  31.88 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  31.91 
 
 
192 aa  61.2  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  30.87 
 
 
213 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  34.51 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
416 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  27.63 
 
 
178 aa  51.6  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  30.28 
 
 
151 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  27.54 
 
 
125 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  31.85 
 
 
124 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2658  GtrA family protein  32.17 
 
 
146 aa  45.4  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0762807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  27.42 
 
 
152 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0406  GtcA family membrane protein  28.57 
 
 
151 aa  44.7  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  31.62 
 
 
160 aa  44.7  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  33.01 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  26.45 
 
 
139 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8840  GtrA family protein  23.78 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  30.51 
 
 
148 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  25.9 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.79 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  29.93 
 
 
496 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  28.47 
 
 
460 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  26.09 
 
 
125 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  20 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2172  GtrA family protein  28.66 
 
 
173 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.594384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  24.48 
 
 
176 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  24.46 
 
 
163 aa  41.6  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>