50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1048 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  100 
 
 		 194 aa  396  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  60 
 
 		 186 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  56.89 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  56.89 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  56.89 
 
 		 229 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  53.67 
 
 		 272 aa  202  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  56.89 
 
 		 227 aa  198  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  56.55 
 
 		 240 aa  197  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  46.29 
 
 		 184 aa  171  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  42.94 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  47.53 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  43.98 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  44.64 
 
 		 171 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  32.16 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  32.18 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  30.9 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  30.5 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  33.12 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  32.54 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  31.03 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  31.54 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  29.08 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  31.71 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  31.68 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  29.73 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  27.7 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  31.94 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  30.43 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  23.49 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  27.53 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  28.57 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  29.33 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  30.77 
 
 		 162 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  27.81 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  27.74 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  28.57 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  23.87 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  26.8 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  26.15 
 
 		 134 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  26.32 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  26.25 
 
 		 165 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  24.03 
 
 		 188 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  30 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  26.67 
 
 		 146 aa  45.1  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2875  GtrA family protein  29.23 
 
 		 160 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  31.51 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  27.15 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  26.05 
 
 		 148 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3627  GtrA family protein  23.36 
 
 		 116 aa  41.2  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4236  GtrA-like protein  31.25 
 
 		 176 aa  41.2  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.246843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>