56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1335 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  60.71 
 
 		 165 aa  184  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  58.87 
 
 		 221 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  48.72 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  42.02 
 
 		 190 aa  139  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  49.24 
 
 		 191 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  45.89 
 
 		 169 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  38.12 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  42.05 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  46.85 
 
 		 155 aa  129  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  46.26 
 
 		 151 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  48.98 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  41.03 
 
 		 166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  46.46 
 
 		 163 aa  115  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  44.19 
 
 		 151 aa  109  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  39.13 
 
 		 169 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  41.73 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  45.88 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  42.22 
 
 		 180 aa  108  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  35.53 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  40 
 
 		 182 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  40.97 
 
 		 231 aa  97.8  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  42.36 
 
 		 230 aa  97.4  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  35.62 
 
 		 200 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  38.26 
 
 		 194 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  39.53 
 
 		 158 aa  89.4  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  38.31 
 
 		 180 aa  88.6  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  35.57 
 
 		 184 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  30.81 
 
 		 188 aa  85.5  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  36.73 
 
 		 165 aa  85.1  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  34.59 
 
 		 171 aa  85.1  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  34.39 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  34.39 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  34.03 
 
 		 184 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  34.39 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  32.76 
 
 		 272 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  33.33 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  32.18 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  31.21 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  35.2 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  38.14 
 
 		 154 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  27.53 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  28.19 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  31.11 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  30.77 
 
 		 139 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0715  hypothetical protein  29.11 
 
 		 142 aa  46.6  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.039698 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  27.05 
 
 		 178 aa  46.2  0.0004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1387  GtrA family protein  21.09 
 
 		 145 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  28.24 
 
 		 155 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5286  gtrA family protein  27.91 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5683  gtrA family protein  27.91 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5527  gtrA family protein  27.91 
 
 		 127 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  31.71 
 
 		 152 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1833  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1342  GtrA family protein  24.27 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00972565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>