22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1387 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1387  GtrA family protein  100 
 
 		 145 aa  283  5.999999999999999e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0406  GtcA family membrane protein  28.78 
 
 		 151 aa  83.6  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1342  GtrA family protein  37.41 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00972565  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1394  GtcA family membrane protein  35.51 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00340458  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1745  GtcA family membrane protein  25.44 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0698  GtcA family membrane protein  26.57 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  21.09 
 
 		 220 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0103  GtcA family membrane protein  27.45 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0609  bactoprenol-linked glucose translocase  27.46 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.268002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0604  bactoprenol-linked glucose translocase  27.46 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4544  bactoprenol-linked glucose translocase  25.71 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0669  bactoprenol-linked glucose translocase  28.17 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4543  bactoprenol-linked glucose translocase  25.71 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663677  normal  0.189983 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0725  bactoprenol-linked glucose translocase  28.17 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.58394 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4459  bactoprenol-linked glucose translocase  25.71 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0660  bactoprenol-linked glucose translocase  28.17 
 
 		 120 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.89521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0633  GtcA family membrane protein  27.56 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4132  GtrA family protein  28.87 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  28.57 
 
 		 169 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0656  bactoprenol-linked glucose translocase  25 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0416  bactoprenol-linked glucose translocase  25 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.966976  hitchhiker  0.000337924 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2747  GtrA family protein  23.44 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>