57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3885 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  100 
 
 		 169 aa  336  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  55.48 
 
 		 155 aa  156  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  48.2 
 
 		 191 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  50 
 
 		 206 aa  140  8e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  44.83 
 
 		 190 aa  134  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  45.89 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  49.29 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  43.71 
 
 		 221 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  48.85 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  47.02 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  45.34 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  47.22 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  45.19 
 
 		 267 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  45.8 
 
 		 182 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  42.36 
 
 		 188 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  41.3 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  41.5 
 
 		 267 aa  104  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  44.96 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  39.1 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  38.03 
 
 		 151 aa  97.4  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  39.72 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  38.64 
 
 		 147 aa  89.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  38.24 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  34.72 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  43.08 
 
 		 230 aa  85.9  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  41.54 
 
 		 231 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  33.92 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  31.55 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  32.93 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  30.54 
 
 		 184 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  35.48 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  35.48 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  35.48 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  31.52 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  36.36 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  34.78 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  31.58 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  32.03 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  41.24 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  34.48 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  34.03 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  35.21 
 
 		 194 aa  62  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  23.49 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  25.81 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0062  glycosyl transferase family protein  31.39 
 
 		 386 aa  48.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.963311 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0245  GtrA family protein  37.04 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.322541  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1331  GtrA family protein  21.71 
 
 		 139 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  28.28 
 
 		 139 aa  45.1  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 		 416 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2498  GtrA family protein  33.09 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2294  GtrA family protein  26.39 
 
 		 152 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4177  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 432 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.69598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3936  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.33 
 
 		 397 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368189  normal  0.118525 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 370 aa  41.6  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  31.3 
 
 		 146 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1387  GtrA family protein  28.57 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>