57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1712 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  100 
 
 		 240 aa  486  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  88.99 
 
 		 227 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  77.06 
 
 		 272 aa  352  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  79.48 
 
 		 229 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  79.13 
 
 		 229 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  79.48 
 
 		 229 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  62.73 
 
 		 186 aa  217  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  62.2 
 
 		 186 aa  208  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  58.43 
 
 		 184 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  56.55 
 
 		 194 aa  197  9e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  57.32 
 
 		 180 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  54.55 
 
 		 171 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  52.05 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  40.28 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  38.69 
 
 		 180 aa  92.4  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  35.51 
 
 		 163 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  38.67 
 
 		 267 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  40 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  29.44 
 
 		 202 aa  88.2  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  35 
 
 		 166 aa  85.1  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  36.17 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  29.27 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  39.26 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  36.49 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  33.52 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  36.43 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  35 
 
 		 165 aa  76.3  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  41.51 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  34.31 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  31.58 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  35.8 
 
 		 162 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  30.67 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  31.34 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  32.67 
 
 		 169 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  30.6 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  28.86 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  29.73 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  30.49 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  26.11 
 
 		 147 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  30.54 
 
 		 178 aa  52.8  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  29.7 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0388  GtrA family protein  22.3 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000665591  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0464  GtrA-like protein  27.89 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  25.56 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  31.91 
 
 		 165 aa  49.3  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  27.46 
 
 		 194 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0149  GtrA family protein  28.15 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2634  GtrA-like protein  34.31 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5937  GtrA family protein  29.68 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0074  GtrA family protein  27.27 
 
 		 146 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4280  GtrA family protein  29.93 
 
 		 125 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.681203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  22.88 
 
 		 155 aa  45.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1564  GtrA-like protein  27.61 
 
 		 148 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.132931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1833  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4545  GtrA family protein  29.93 
 
 		 125 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.881493 
 
 
-
 
NC_002950  PG0917  GtrA family protein  37.31 
 
 		 131 aa  42.4  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.630955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>