47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_08400 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  57.64 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  56.93 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  52.29 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  49.36 
 
 		 166 aa  144  9e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  43.4 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  46.5 
 
 		 165 aa  129  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  45.88 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  38.24 
 
 		 202 aa  126  2.0000000000000002e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  45.34 
 
 		 169 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  52.86 
 
 		 162 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  40.74 
 
 		 191 aa  121  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  39.53 
 
 		 190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  43.21 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  39.66 
 
 		 267 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  41.13 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  41.56 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  52.04 
 
 		 154 aa  98.2  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  97.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  33.64 
 
 		 200 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  32.82 
 
 		 184 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  34.97 
 
 		 186 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  29.27 
 
 		 240 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  34.36 
 
 		 180 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  34.97 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  30.22 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  35.67 
 
 		 169 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  30.22 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  30.22 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  33.74 
 
 		 171 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  30.05 
 
 		 227 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  34.71 
 
 		 272 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  43.8 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  41.61 
 
 		 231 aa  83.6  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  36.94 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  30.93 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  29.83 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  36.81 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  33.33 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  30.57 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  35.21 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  34.78 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  28.57 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  24.4 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  32.24 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  27.72 
 
 		 139 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  22.36 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>