31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1268 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  361  4e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  57.23 
 
 
171 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  45.38 
 
 
139 aa  104  8e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  33.85 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  32.03 
 
 
221 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  31.87 
 
 
267 aa  57  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  32.98 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  30 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  28.74 
 
 
227 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  30.54 
 
 
240 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  24.32 
 
 
267 aa  52.8  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  27.63 
 
 
186 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  33.08 
 
 
165 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  28.39 
 
 
272 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  27.05 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  25.74 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  27.82 
 
 
151 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  32.98 
 
 
163 aa  48.5  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  24.49 
 
 
190 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  27.74 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  27.05 
 
 
220 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  24.63 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  30.34 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  30.34 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  30.34 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  27.38 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  26.32 
 
 
202 aa  41.6  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  30.43 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  27.21 
 
 
151 aa  41.6  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  29.55 
 
 
184 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  22.73 
 
 
169 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>