33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0198 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  100 
 
 		 171 aa  340  5.999999999999999e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  58.38 
 
 		 178 aa  191  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  48.61 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  31.65 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  30.77 
 
 		 155 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  26.28 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  32.63 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  30.1 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  29.32 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  31.87 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  31.18 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  25.34 
 
 		 272 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  33.72 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  29.3 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  23.97 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  26.21 
 
 		 267 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  25.34 
 
 		 227 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  30 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  26.03 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  26.03 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  26.03 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  23.97 
 
 		 240 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  21.6 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  25.83 
 
 		 194 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  24.49 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  25 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3623  GtrA family protein  28.46 
 
 		 141 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  25.53 
 
 		 158 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  22.52 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  26.17 
 
 		 200 aa  41.2  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  23.7 
 
 		 186 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  26.8 
 
 		 169 aa  41.2  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  28.4 
 
 		 151 aa  40.8  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>