52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3212 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  100 
 
 		 151 aa  308  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  48.46 
 
 		 221 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  51.61 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  46.26 
 
 		 220 aa  124  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  41.61 
 
 		 206 aa  106  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  39.1 
 
 		 169 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  42.11 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  36 
 
 		 191 aa  94  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  38.93 
 
 		 155 aa  91.3  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  42.97 
 
 		 162 aa  89.4  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  35.2 
 
 		 190 aa  88.2  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  37.23 
 
 		 267 aa  87  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  36.72 
 
 		 163 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  36.23 
 
 		 267 aa  86.3  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  33.33 
 
 		 169 aa  85.5  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  37.88 
 
 		 230 aa  84.3  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  39.55 
 
 		 180 aa  84.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  37.4 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  34.09 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  34.78 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  34.03 
 
 		 165 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  38.46 
 
 		 158 aa  73.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  31.62 
 
 		 184 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  35 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  32.84 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  32.09 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  32.09 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  32.09 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  30.77 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  30.6 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  30.14 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  41.86 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  30.6 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  31.06 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  30.6 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  30.77 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  34.88 
 
 		 184 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  34.11 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  28.57 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  27.07 
 
 		 186 aa  57  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  36.36 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  29.56 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  30.23 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  27.82 
 
 		 178 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  26.87 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  26.24 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5873  GtrA family protein  43.64 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.65423  normal  0.230347 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5509  GtrA-like protein  43.64 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2056  GtrA family protein  23.39 
 
 		 149 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0085  GtrA family protein  23.39 
 
 		 149 aa  40  0.01  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>