54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0709 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0709  GtrA family protein  100 
 
 		 165 aa  329  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.399351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1335  membrane protein-like protein  60.71 
 
 		 220 aa  184  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105577  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4120  GtrA family protein  55.56 
 
 		 221 aa  167  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3212  GtrA family protein  51.61 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0404  GtrA family protein  54.25 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0707  GtrA-like protein  48.25 
 
 		 190 aa  130  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3885  GtrA family protein  49.29 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3907  GtrA family protein  46.63 
 
 		 206 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5907  GtrA family protein  47.76 
 
 		 191 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.82462  normal  0.606747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2548  hypothetical protein  45.51 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1157  GtrA family protein  46.48 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3935  GtrA family protein  49.22 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.102496  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08400  predicted membrane protein  46.5 
 
 		 220 aa  114  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0672665  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0860  GtrA family protein  46.04 
 
 		 267 aa  113  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.248898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0801  GtrA family protein  43.24 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0806  GtrA family protein  43.15 
 
 		 267 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08530  predicted membrane protein  47.73 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0370577  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0859  GtrA family protein  45.83 
 
 		 230 aa  97.4  7e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.136831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0805  GtrA family protein  43.06 
 
 		 231 aa  97.1  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000471677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0802  GtrA family protein  39.72 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.859462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4358  GtrA family protein  43.08 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.558529  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1869  GtrA family protein  36.43 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0307659  normal  0.124929 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05250  predicted membrane protein  39.44 
 
 		 202 aa  90.5  9e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.32807  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0838  GtrA family protein  40.52 
 
 		 182 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999356  hitchhiker  0.0000000072183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3747  membrane protein-like protein  37.25 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0691134  normal  0.125763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6378  GtrA family protein  37.18 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05020  predicted membrane protein  39.01 
 
 		 171 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1333  GtrA family protein  37.86 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1297  GtrA-like protein  37.86 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06000  predicted membrane protein  34.27 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.284035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1314  GtrA family protein  37.86 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.143944 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13306  transmembrane protein  35.71 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4221  GtrA family protein  36.88 
 
 		 200 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00539121  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4748  GtrA family protein  36.43 
 
 		 227 aa  77.4  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.498469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1712  GtrA family protein  35 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30110  predicted membrane protein  36.99 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0837  GtrA family protein  35.94 
 
 		 213 aa  70.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.399526  hitchhiker  0.000000050158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1261  GtrA family protein  36.76 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000588379 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1048  GtrA family protein  31.54 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0393797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1190  GtrA family protein  36.76 
 
 		 194 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1846  GtrA family protein  30.56 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0590312  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4648  GtrA family protein  35.37 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1597  GtrA family protein  41.05 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1247  GtrA family protein  35.71 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.300444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3505  GtrA family protein  31.43 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.467661  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3881  GtrA family protein  33.6 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1268  hypothetical protein  33.08 
 
 		 178 aa  51.2  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1743  hypothetical protein  29.05 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4106  GtrA family protein  32.63 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.327581  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0406  GtcA family membrane protein  29.41 
 
 		 151 aa  47.8  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0267  GtrA family protein  32.77 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0198  GtrA-like protein  27.82 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4309  GtrA family protein  29.79 
 
 		 134 aa  41.2  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.92093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23230  predicted membrane protein  23.77 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>